Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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