Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Mrpl28Q9D1B9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
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Mrpl28Q9D1B9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl28Q9D1B9 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl28Q9D1B9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl28Q9D1B9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl28Q9D1B9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Mrpl28Q9D1B9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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