Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms