Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Q9CQ90 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Q9CQ90 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Q9CQ90 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Q9CQ90 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Q9CQ90 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CQ90 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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