Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms