Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms