Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms