Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms