Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cabp4Q8VHC5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms