Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Hoxc12Q8K5B8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Hoxc12Q8K5B8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Hoxc12Q8K5B8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Hoxc12Q8K5B8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Hoxc12Q8K5B8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Hoxc12Q8K5B8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Hoxc12Q8K5B8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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