Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc9Q8CDN9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc9Q8CDN9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc9Q8CDN9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc9Q8CDN9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc9Q8CDN9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc9Q8CDN9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms