Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp20Q8C6M1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp20Q8C6M1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp20Q8C6M1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp20Q8C6M1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp20Q8C6M1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp20Q8C6M1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp20Q8C6M1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp20Q8C6M1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp20Q8C6M1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp20Q8C6M1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp20Q8C6M1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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