Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp5Q8BX09 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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