Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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