Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnpy4Q8BQ47 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy4Q8BQ47 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms