Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms