Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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H2-M10.4Q85ZW8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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