Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgef17Q80U35 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms