Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim37Q6PCX9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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