Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb40Q6PCS8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms