Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bend3Q6PAL0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms