Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms