Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms