Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AcanQ61282 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms