Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms