Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms