Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms