Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hbq1bQ3U0A6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms