Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms