Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms