Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms