Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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VgfQ0VGU4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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VgfQ0VGU4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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VgfQ0VGU4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms