Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col1a2Q01149 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms