Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AlkP97793 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AlkP97793 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AlkP97793 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AlkP97793 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AlkP97793 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AlkP97793 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AlkP97793 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms