Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snrpd1P62315 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms