Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp20P57748 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp20P57748 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms