Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp25P57080 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp25P57080 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp25P57080 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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