Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CartptP56388 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CartptP56388 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CartptP56388 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CartptP56388 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CartptP56388 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CartptP56388 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CartptP56388 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CartptP56388 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CartptP56388 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms