Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NcanP55066 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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