Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VhlP40338 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VhlP40338 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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