Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms