Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NdnP25233 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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