Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12P23812 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms