Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RarbP22605 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RarbP22605 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RarbP22605 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RarbP22605 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RarbP22605 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RarbP22605 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RarbP22605 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RarbP22605 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RarbP22605 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RarbP22605 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RarbP22605 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RarbP22605 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RarbP22605 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RarbP22605 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms