Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NelfeP19426 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NelfeP19426 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NelfeP19426 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms