Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NefhP19246 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NefhP19246 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NefhP19246 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NefhP19246 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NefhP19246 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NefhP19246 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NefhP19246 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NefhP19246 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NefhP19246 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NefhP19246 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NefhP19246 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms