Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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H2-Ab1P01921 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms