Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MttpO08601 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MttpO08601 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MttpO08601 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms