Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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