Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms